15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_R0001 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_R0001  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.3029e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS01509  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0065  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0046  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.837906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0003  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856118  normal  0.0346282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0004  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0022  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.928948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0027  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0005  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4794  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19030  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0020  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0046  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54840  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000068368  unclonable  1.75195e-22 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60400  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.589657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>