More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0679 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0679  phosphate transporter  100 
 
 
349 aa  674    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  48.95 
 
 
329 aa  306  5.0000000000000004e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  43.84 
 
 
332 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  42.44 
 
 
332 aa  268  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  42.07 
 
 
333 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  43.94 
 
 
333 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3506  phosphate transporter  49.21 
 
 
339 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000418556  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  42.2 
 
 
333 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  44.41 
 
 
338 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  42.03 
 
 
333 aa  260  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  41.19 
 
 
335 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  41.19 
 
 
335 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  44.48 
 
 
337 aa  256  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4358  phosphate transporter  45.67 
 
 
335 aa  253  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000836516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  41.87 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  45.21 
 
 
326 aa  252  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2626  phosphate transporter  43.99 
 
 
327 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  43.31 
 
 
334 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3585  phosphate transporter  41.82 
 
 
333 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121636  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  42.94 
 
 
385 aa  247  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2876  phosphate transporter  38.79 
 
 
332 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000456437  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  44.38 
 
 
333 aa  245  8e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  41.1 
 
 
336 aa  245  9e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0762  phosphate transporter  41.35 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217274  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2027  phosphate transporter  45.07 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  42.6 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  41.77 
 
 
332 aa  242  6e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0317  phosphate transporter family protein  40.29 
 
 
336 aa  241  1e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.178517  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1960  phosphate transporter  45.4 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  43.34 
 
 
370 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3021  phosphate transporter  39.37 
 
 
332 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  41.36 
 
 
336 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  42.14 
 
 
332 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1083  phosphate transporter  42.94 
 
 
336 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2031  phosphate transporter  42.11 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  42.51 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1545  phosphate transporter family protein  39.13 
 
 
332 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000352137 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1576  phosphate transporter family protein  38.84 
 
 
332 aa  233  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000371851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1361  phosphate transporter family protein  39.13 
 
 
332 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000679914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1335  phosphate transporter  39.13 
 
 
332 aa  233  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000375914  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1334  phosphate transporter  39.13 
 
 
332 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000421375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1471  phosphate transporter family protein  39.13 
 
 
332 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.466845  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1614  phosphate transporter family protein  38.84 
 
 
332 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000923139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3837  phosphate transporter family protein  39.13 
 
 
332 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0211808  hitchhiker  0.000000000133014 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1678  phosphate transporter  41.52 
 
 
334 aa  232  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397083  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2658  phosphate transporter  40.18 
 
 
332 aa  232  9e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1508  phosphate transporter family protein  38.84 
 
 
332 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0297003  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33540  phosphate/sulfate permease  44.11 
 
 
334 aa  231  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0469788  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0563  phosphate transporter family protein  41.92 
 
 
332 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0549  phosphate permease  41.62 
 
 
332 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1376  phosphate transporter  39.42 
 
 
332 aa  231  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000403006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2499  phosphate transporter  41.18 
 
 
346 aa  229  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.617445  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0300  phosphate transporter  46.5 
 
 
332 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.942291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2552  phosphate transporter  40.94 
 
 
354 aa  229  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.729981  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  38.89 
 
 
336 aa  229  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  38.89 
 
 
336 aa  229  7e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  40 
 
 
336 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2817  phosphate transporter  45.02 
 
 
334 aa  227  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.011171 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  39.2 
 
 
336 aa  227  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  40 
 
 
336 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  42.39 
 
 
331 aa  226  4e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1178  phosphate transporter  38.37 
 
 
332 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010062  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2335  phosphate transporter  42.06 
 
 
336 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  39.32 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3393  phosphate transporter  40 
 
 
334 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0871  phosphate transporter  41.69 
 
 
330 aa  225  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3421  phosphate transporter  43.84 
 
 
337 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2217  phosphate transporter  41.95 
 
 
427 aa  224  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4378  phosphate transporter  40 
 
 
353 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0749407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0775  phosphate transporter  42.55 
 
 
328 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123226 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5202  phosphate transporter  40.43 
 
 
334 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2523  phosphate transporter  41.23 
 
 
338 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1406  phosphate transporter  39.08 
 
 
336 aa  222  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.596183  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0043  phosphate transporter  41.23 
 
 
331 aa  222  8e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0027  hypothetical protein  39.39 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0028  hypothetical protein  39.39 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5168  phosphate transporter  39.08 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0592  phosphate transporter  39.08 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5472  phosphate transporter  39.82 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0326  phosphate transporter  42.24 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  38.77 
 
 
336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1881  phosphate transporter  39.81 
 
 
336 aa  220  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0843  phosphate transporter  39.76 
 
 
332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  38.34 
 
 
336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1687  phosphate transporter  37.96 
 
 
336 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0241  phosphate transporter  40.29 
 
 
334 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1777  phosphate transporter  38.51 
 
 
336 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1805  phosphate transporter  38.51 
 
 
336 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0283  phosphate transporter  42.25 
 
 
334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0849813 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1891  phosphate transporter  38.41 
 
 
336 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123921  hitchhiker  0.0000000789991 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6211  phosphate transporter  38.41 
 
 
336 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1868  phosphate transporter  38.41 
 
 
336 aa  216  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3161  phosphate transporter  40.66 
 
 
336 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1748  phosphate transporter  42.86 
 
 
332 aa  215  8e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0493657 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4384  phosphate transporter  42.6 
 
 
352 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.622735  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1404  phosphate transporter  37.96 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2185  phosphate transporter family protein  38.96 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2946  phosphate transporter  39.19 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.747547  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2245  phosphate transporter family protein  38.96 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1888  phosphate transporter family protein  38.96 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.527303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>