More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2523 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2523  phosphate transporter  100 
 
 
338 aa  656    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2335  phosphate transporter  94.63 
 
 
336 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3161  phosphate transporter  96.41 
 
 
336 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2031  phosphate transporter  92.49 
 
 
334 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  88.41 
 
 
336 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2946  phosphate transporter  92.38 
 
 
334 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.747547  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1678  phosphate transporter  88.89 
 
 
334 aa  565  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397083  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3393  phosphate transporter  76.28 
 
 
334 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5972  phosphate transporter  79.2 
 
 
334 aa  463  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8018  phosphate transporter  80.48 
 
 
335 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325586  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5202  phosphate transporter  76.45 
 
 
334 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5472  phosphate transporter  75 
 
 
333 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3605  phosphate transporter  73.99 
 
 
332 aa  431  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0775  phosphate transporter  74.52 
 
 
328 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.123226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2000  phosphate transporter  62.7 
 
 
335 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1414  phosphate transporter  69.16 
 
 
329 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1777  phosphate transporter  60.74 
 
 
336 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  63.55 
 
 
336 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1406  phosphate transporter  60.73 
 
 
336 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.596183  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  62.46 
 
 
336 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1973  phosphate transporter  63.09 
 
 
336 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137015  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1805  phosphate transporter  60.74 
 
 
336 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  63.55 
 
 
336 aa  384  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  63.81 
 
 
336 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  63.09 
 
 
336 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5168  phosphate transporter  60.74 
 
 
336 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0592  phosphate transporter  60.42 
 
 
336 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  62.26 
 
 
336 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1687  phosphate transporter  62.62 
 
 
336 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  63.09 
 
 
336 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  60.76 
 
 
336 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6211  phosphate transporter  61.94 
 
 
336 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450178  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1868  phosphate transporter  61.94 
 
 
336 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1891  phosphate transporter  61.94 
 
 
336 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123921  hitchhiker  0.0000000789991 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1152  phosphate transporter  61.51 
 
 
336 aa  372  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2245  phosphate transporter family protein  61.61 
 
 
336 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1398  phosphate transporter family protein  61.61 
 
 
336 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  59.06 
 
 
335 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2410  phosphate transporter family protein  61.61 
 
 
354 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2185  phosphate transporter family protein  61.61 
 
 
354 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  62.66 
 
 
331 aa  369  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2284  phosphate transporter family protein  61.61 
 
 
336 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1161  phosphate transporter family protein  61.61 
 
 
336 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1888  phosphate transporter family protein  61.61 
 
 
336 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.527303  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0008  phosphate transporter family protein  61.61 
 
 
336 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0756499  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0917  phosphate transporter  63.55 
 
 
336 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  normal  0.295731 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0843  phosphate transporter  57.75 
 
 
332 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2395  phosphate transporter  61.04 
 
 
336 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38618  normal  0.093565 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0678  phosphate transporter  60.49 
 
 
336 aa  361  8e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1881  phosphate transporter  61.83 
 
 
336 aa  360  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1404  phosphate transporter  60.95 
 
 
336 aa  357  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0717  phosphate transporter  57.78 
 
 
337 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5348  phosphate transporter  61.61 
 
 
336 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1792  phosphate transporter  62.46 
 
 
336 aa  348  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0559  phosphate transporter  58.97 
 
 
313 aa  343  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4378  phosphate transporter  55.52 
 
 
353 aa  338  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0749407 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4384  phosphate transporter  54.98 
 
 
352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.622735  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0027  hypothetical protein  55.41 
 
 
331 aa  326  3e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0028  hypothetical protein  55.41 
 
 
331 aa  326  3e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4361  phosphate transporter  54.98 
 
 
352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4228  phosphate transporter  54.68 
 
 
352 aa  325  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  50.78 
 
 
333 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  49.22 
 
 
333 aa  305  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  49.54 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0892  phosphate transporter  51.81 
 
 
334 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3131  phosphate transporter  55.29 
 
 
345 aa  298  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150684  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  47.98 
 
 
333 aa  298  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  48.15 
 
 
332 aa  296  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0762  phosphate transporter  52.63 
 
 
343 aa  296  5e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217274  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  49.35 
 
 
333 aa  295  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  47.04 
 
 
329 aa  293  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3585  phosphate transporter  49.84 
 
 
333 aa  292  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121636  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  50.33 
 
 
338 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  49.68 
 
 
332 aa  287  2e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0190  phosphate transporter  50.48 
 
 
336 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.177955 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1960  phosphate transporter  51.6 
 
 
334 aa  285  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  49.38 
 
 
336 aa  285  9e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  49.84 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0180  phosphate transporter  51.83 
 
 
334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  49.71 
 
 
370 aa  282  7.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  49.04 
 
 
336 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  44.68 
 
 
332 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  49.84 
 
 
385 aa  278  9e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  51.98 
 
 
333 aa  276  4e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  49.05 
 
 
326 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0740  phosphate transporter  49.55 
 
 
336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2027  phosphate transporter  51.1 
 
 
333 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1083  phosphate transporter  48.71 
 
 
336 aa  271  8.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0326  phosphate transporter  48.47 
 
 
334 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3421  phosphate transporter  51.42 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2217  phosphate transporter  45.87 
 
 
427 aa  266  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0563  phosphate transporter family protein  47.52 
 
 
332 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0549  phosphate permease  47.83 
 
 
332 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0871  phosphate transporter  52.55 
 
 
330 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  46.15 
 
 
332 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0300  phosphate transporter  52.38 
 
 
332 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.942291  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4259  phosphate transporter  47.95 
 
 
332 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0283  phosphate transporter  48.59 
 
 
334 aa  262  6e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0849813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5449  phosphate transporter  46.06 
 
 
386 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0370554  normal  0.318098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0241  phosphate transporter  47.95 
 
 
334 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>