25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0643 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0643  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 503 aa  952    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3076  flagellar hook-length control protein  53.26 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3802  flagellar hook-length control protein  51.02 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4390  flagellar hook-length control protein  54.43 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1118  hypothetical protein  48.1 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.976416  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0555  flagellar hook-length control protein  32.84 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  45.28 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  32.93 
 
 		 491 aa  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  43.4 
 
 		 585 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02883  polar flagellar hook-length control protein FliK  28.87 
 
 		 768 aa  47.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0438685  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  30.67 
 
 		 674 aa  47.4  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1545  flagellar hook-length control protein  34.41 
 
 		 523 aa  47.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  39.62 
 
 		 527 aa  47  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  38.18 
 
 		 568 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  41.18 
 
 		 579 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  39.58 
 
 		 702 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  39.58 
 
 		 718 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  40.91 
 
 		 717 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0195  flagellar hook-length control protein, putative  31.76 
 
 		 465 aa  45.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  40.91 
 
 		 537 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  34.21 
 
 		 623 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  30.43 
 
 		 487 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  34.67 
 
 		 686 aa  43.9  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1021  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 		 490 aa  43.9  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0438  flagellar hook-length control protein  32.56 
 
 		 504 aa  43.5  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00196038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>