47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0555 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0555  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 394 aa  766    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3076  flagellar hook-length control protein  46.39 
 
 		 436 aa  90.1  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3802  flagellar hook-length control protein  46.39 
 
 		 436 aa  89.7  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4390  flagellar hook-length control protein  47.67 
 
 		 477 aa  87  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1118  hypothetical protein  45.22 
 
 		 455 aa  86.3  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.976416  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0643  flagellar hook-length control protein  39.53 
 
 		 503 aa  66.6  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  34.74 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  33.94 
 
 		 512 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  34.74 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  33.68 
 
 		 579 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  34.74 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  33.67 
 
 		 544 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  33.68 
 
 		 585 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 717 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 702 aa  56.6  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  33.33 
 
 		 718 aa  56.2  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  27.27 
 
 		 495 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  31.76 
 
 		 537 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2177  flagellar hook-length control protein-like  27.61 
 
 		 485 aa  53.5  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.025521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  29.21 
 
 		 568 aa  53.5  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3439  flagellar hook-length control protein  36.78 
 
 		 567 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  32.35 
 
 		 508 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  32.05 
 
 		 408 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  32.32 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2580  flagellar hook-length control protein  28.57 
 
 		 431 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.549964  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0768  flagellar hook-length control protein  29.46 
 
 		 335 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.383944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  31.58 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  30.34 
 
 		 324 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1886  flagellar hook-length control protein  26.43 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3061  flagellar hook-length control protein  35.16 
 
 		 609 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.15551  normal  0.0461289 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1545  flagellar hook-length control protein  38.36 
 
 		 523 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45830  hypothetical protein  30.7 
 
 		 427 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5102  flagellar hook-length control protein  37.68 
 
 		 487 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.290575  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  24.19 
 
 		 593 aa  46.6  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1571  flagellar hook-length control protein  35.63 
 
 		 443 aa  46.6  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1021  flagellar hook-length control protein  35.8 
 
 		 490 aa  46.6  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1350  flagellar hook-length control protein  30.58 
 
 		 480 aa  46.6  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5266  flagellar hook-length control protein  36.11 
 
 		 495 aa  46.6  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.265097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2905  flagellar hook-length control protein  32.8 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6418  flagellar hook-length control protein  29.79 
 
 		 447 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1605  putative flagellar hook-length control protein FliK  32.43 
 
 		 360 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.107418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3114  flagellar hook-length control protein  29.79 
 
 		 455 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  30.23 
 
 		 434 aa  43.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  30.23 
 
 		 434 aa  43.1  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2396  flagellar hook-length control protein  32.18 
 
 		 450 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2295  flagellar hook-length control protein  32.18 
 
 		 452 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1186  putative flagellar hook-length control protein  28.33 
 
 		 580 aa  42.7  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>