48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3802 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3802  flagellar hook-length control protein  100 
 
 
436 aa  798    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101066  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3076  flagellar hook-length control protein  97.25 
 
 
436 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4390  flagellar hook-length control protein  71.25 
 
 
477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1118  hypothetical protein  46.01 
 
 
455 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.976416  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0643  flagellar hook-length control protein  50.46 
 
 
503 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0555  flagellar hook-length control protein  48.51 
 
 
394 aa  94  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  35.71 
 
 
389 aa  60.1  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  31.54 
 
 
487 aa  57.4  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0768  flagellar hook-length control protein  25.9 
 
 
335 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.383944  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2817  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 
408 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0900744 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  37.78 
 
 
324 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2177  flagellar hook-length control protein-like  37.23 
 
 
485 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.025521  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  35.9 
 
 
434 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  35.9 
 
 
434 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1350  flagellar hook-length control protein  30 
 
 
480 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0161  putative flagellar hook-length control protein  29.7 
 
 
487 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1711  putative flagellar hook-length control protein FliK  37.04 
 
 
674 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  35.71 
 
 
586 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3114  flagellar hook-length control protein  32.69 
 
 
455 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3888  hypothetical protein  29.29 
 
 
428 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  34.21 
 
 
686 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1605  putative flagellar hook-length control protein FliK  32.47 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.107418 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  32.89 
 
 
623 aa  48.5  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  34.69 
 
 
585 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  30.69 
 
 
491 aa  47.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6418  flagellar hook-length control protein  32.97 
 
 
447 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3042  flagellar hook-length control protein  31.78 
 
 
723 aa  47  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835952  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  35.06 
 
 
579 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3088  flagellar hook-length control protein  30.83 
 
 
456 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  32.65 
 
 
527 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1657  hypothetical protein  21.13 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1021  flagellar hook-length control protein  32.1 
 
 
490 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1507  putative flagellar hook-length control protein  31.76 
 
 
660 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.838135  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2455  flagellar hook-length control protein  31.15 
 
 
452 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0513152  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2980  flagellar hook-length control protein  32.53 
 
 
455 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741778  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3069  flagellar hook-length control protein  31.15 
 
 
452 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127947  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0217  flagellar hook-length control protein FliK  31.33 
 
 
455 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  33.77 
 
 
718 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1973  flagellar hook-length control protein  36.11 
 
 
373 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3276  flagellar hook-length control protein  31.03 
 
 
466 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3405  flagellar hook-length control protein  31.03 
 
 
466 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2147  flagellar hook-length control protein  31.03 
 
 
458 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  33.77 
 
 
537 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  32.94 
 
 
568 aa  44.7  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  33.77 
 
 
717 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  33.77 
 
 
702 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0229  flagellar hook-length control protein FliK  31.33 
 
 
458 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0412  flagellar hook-length control protein, putative  31.03 
 
 
677 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.711006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>