51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4390 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4390  flagellar hook-length control protein  100 
 
 		 477 aa  883    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3076  flagellar hook-length control protein  60.34 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3802  flagellar hook-length control protein  60.34 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.101066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1118  hypothetical protein  44.9 
 
 		 455 aa  114  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.976416  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0643  flagellar hook-length control protein  45.74 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0555  flagellar hook-length control protein  39.35 
 
 		 394 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1875  flagellar hook-length control protein  32.97 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal  0.436582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2571  flagellar hook-length control protein  30.61 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3088  flagellar hook-length control protein  30.28 
 
 		 456 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2177  flagellar hook-length control protein-like  34 
 
 		 485 aa  55.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.025521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1347  flagellar hook-length control protein  33.98 
 
 		 579 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371823 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1287  flagellar hook-length control protein  33.98 
 
 		 586 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3223  flagellar hook-length control protein FliK  33.01 
 
 		 527 aa  53.5  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1354  flagellar hook-length control protein  33.01 
 
 		 585 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2936  flagellar hook-length control protein  32.5 
 
 		 503 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2980  flagellar hook-length control protein  29.63 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741778  normal  0.672643 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0217  flagellar hook-length control protein FliK  31.33 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.478387  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1371  flagellar hook-length control protein  32.94 
 
 		 568 aa  51.6  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.358506  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3114  flagellar hook-length control protein  29.63 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0161  putative flagellar hook-length control protein  29.81 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1623  flagellar hook-length control protein  22.94 
 
 		 544 aa  51.2  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1329  flagellar hook-length control protein  28.17 
 
 		 495 aa  51.2  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214505  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3276  flagellar hook-length control protein  31.33 
 
 		 466 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3405  flagellar hook-length control protein  31.33 
 
 		 466 aa  50.8  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3066  flagellar hook-length control protein  29.91 
 
 		 449 aa  50.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0768  flagellar hook-length control protein  28.74 
 
 		 335 aa  50.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.383944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2147  flagellar hook-length control protein  31.33 
 
 		 458 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3069  flagellar hook-length control protein  29.36 
 
 		 452 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127947  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2455  flagellar hook-length control protein  29.36 
 
 		 452 aa  50.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0513152  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0229  flagellar hook-length control protein FliK  31.33 
 
 		 458 aa  50.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3775  flagellar hook-length control protein  28.75 
 
 		 497 aa  50.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0412  flagellar hook-length control protein, putative  31.33 
 
 		 677 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.711006  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2354  flagellar hook-length control protein  28.92 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0195  flagellar hook-length control protein, putative  28.46 
 
 		 465 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2931  flagellar hook-length control protein  33.77 
 
 		 717 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3063  flagellar hook-length control protein  33.77 
 
 		 718 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.954903  normal  0.750482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1187  flagellar hook-length control protein  28.47 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1442  flagellar hook-length control protein  33.77 
 
 		 702 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.822312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2921  flagellar hook-length control protein  33.77 
 
 		 537 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2292  flagellar hook-length control protein FliK  30.53 
 
 		 593 aa  47  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6418  flagellar hook-length control protein  28.92 
 
 		 447 aa  47  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.865119 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0438  flagellar hook-length control protein  24.01 
 
 		 504 aa  46.6  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00196038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1021  flagellar hook-length control protein  29.11 
 
 		 490 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00976  flagellar protein  28.92 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06190  flagellar protein  28.92 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0480838  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1657  hypothetical protein  24.55 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1366  flagellar hook-length control protein  32.35 
 
 		 508 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0847  flagellar hook-length control protein  38.46 
 
 		 504 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1964  Flagellar hook-length control protein-like protein  30.11 
 
 		 324 aa  44.3  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03156  hypothetical protein  25.27 
 
 		 686 aa  43.9  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002820  flagellar hook-length control protein FliK  24.21 
 
 		 623 aa  43.5  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>