45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1118 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1118  acetyltransferase  100 
 
 
157 aa  325  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.334853  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1103  GCN5-related N-acetyltransferase  44.52 
 
 
167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2033  acetyltransferase  38.89 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.832186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4589  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 
167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1561  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4824  acetyltransferase  33.96 
 
 
163 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0441  acetyltransferase, gnat family  33.95 
 
 
167 aa  102  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4514  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
163 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4819  acetyltransferase, gnat family  33.33 
 
 
163 aa  101  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.866921  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0639  GCN5-related N-acetyltransferase  35.22 
 
 
163 aa  101  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4033  GCN5-related N-acetyltransferase  37.76 
 
 
163 aa  100  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.910853  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4797  acetyltransferase, gnat family  32.7 
 
 
163 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0598  GCN5-related N-acetyltransferase  34.59 
 
 
163 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.408696  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3450  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
172 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0165  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2254  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
166 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  28.77 
 
 
319 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  27.4 
 
 
319 aa  58.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2038  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.101901  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0913  N-acetyltransferase-like  30.1 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.981182 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1839  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 
152 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.804646  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  32.93 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3992  GCN5-related N-acetyltransferase  25.96 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0146762 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1792  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
169 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184846  normal  0.722227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 
149 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  27.93 
 
 
184 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0977  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00779954  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00546663  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  25.51 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.676163  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2328  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
146 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000658467  normal  0.508858 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2177  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  34.33 
 
 
152 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4636  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3861  GCN5-related N-acetyltransferase  33 
 
 
173 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3649  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.51 
 
 
311 aa  42.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00196269  normal  0.251982 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1922  acetyltransferase (GNAT) family protein  22.9 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641628  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0741  GCN5-related N-acetyltransferase  30.84 
 
 
147 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  27.1 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3178  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
173 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1761  acetyltransferase  27.38 
 
 
191 aa  40.8  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2571  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.2 
 
 
314 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.808395  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 
170 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.236915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>