28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3098 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3098  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  227  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000402787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2227  hypothetical protein  43.1 
 
 
121 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.886761  hitchhiker  0.00000158862 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0956  hypothetical protein  38.1 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0108285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1820  hypothetical protein  31.9 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5208  hypothetical protein  38.2 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.954261  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0572  hypothetical protein  31.13 
 
 
116 aa  60.8  0.000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.767573  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2055  hypothetical protein  28.7 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3051  hypothetical protein  31.53 
 
 
122 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5608  hypothetical protein  41.57 
 
 
120 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.345885  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5221  hypothetical protein  38.1 
 
 
114 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1439  hypothetical protein  30.77 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00180208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8188  hypothetical protein  25 
 
 
159 aa  53.5  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2682  hypothetical protein  27.84 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0836033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5558  hypothetical protein  40.23 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3016  hypothetical protein  30.28 
 
 
122 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0972901  hitchhiker  0.0000118668 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2569  hypothetical protein  26.47 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0214  hypothetical protein  31.73 
 
 
117 aa  50.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1420  hypothetical protein  28 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000234918  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08970  hypothetical protein  25.69 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.197478 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0753  hypothetical protein  30.68 
 
 
133 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00167416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5399  hypothetical protein  38.37 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3792  hypothetical protein  25.22 
 
 
126 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3945  hypothetical protein  35.48 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2414  hypothetical protein  28.04 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.437891 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3150  hypothetical protein  36.36 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3251  hypothetical protein  33.94 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.072777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0091  hypothetical protein  41.96 
 
 
124 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3052  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>