14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3051 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_3051  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  247  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5208  hypothetical protein  36.08 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.954261  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1439  hypothetical protein  29.17 
 
 
118 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00180208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2682  hypothetical protein  34.09 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0836033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3098  hypothetical protein  30.28 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000402787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8188  hypothetical protein  29.17 
 
 
159 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2227  hypothetical protein  24.78 
 
 
121 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.886761  hitchhiker  0.00000158862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08970  hypothetical protein  28.7 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.197478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2569  hypothetical protein  33 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0956  hypothetical protein  28.3 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0108285  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2055  hypothetical protein  26.67 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3016  hypothetical protein  25.23 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0972901  hitchhiker  0.0000118668 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1420  hypothetical protein  24.78 
 
 
117 aa  41.6  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000234918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1820  hypothetical protein  31.58 
 
 
142 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>