20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0572 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0572  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  222  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.767573  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1439  hypothetical protein  37.84 
 
 
118 aa  62  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00180208  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2055  hypothetical protein  30.97 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5608  hypothetical protein  34.41 
 
 
120 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.345885  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0956  hypothetical protein  31.07 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0108285  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1820  hypothetical protein  23.71 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2569  hypothetical protein  25.23 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2414  hypothetical protein  32.97 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.437891 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2682  hypothetical protein  32.61 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0836033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5399  hypothetical protein  33.33 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5558  hypothetical protein  32.97 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2227  hypothetical protein  25 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.886761  hitchhiker  0.00000158862 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3098  hypothetical protein  31.13 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000402787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5221  hypothetical protein  33.7 
 
 
114 aa  52.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1420  hypothetical protein  32.71 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000234918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3945  hypothetical protein  32.26 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08970  hypothetical protein  25.51 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.197478 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0998  hypothetical protein  28.87 
 
 
128 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5208  hypothetical protein  30.23 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.954261  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2354  hypothetical protein  27.16 
 
 
130 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00810351  hitchhiker  0.0000298735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>