13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0214 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0214  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  228  2e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2055  hypothetical protein  31.09 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1420  hypothetical protein  36.21 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000234918  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3098  hypothetical protein  31.9 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000402787  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3792  hypothetical protein  26.13 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1439  hypothetical protein  31.67 
 
 		 118 aa  51.2  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00180208  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08970  hypothetical protein  26.09 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.197478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3016  hypothetical protein  30.77 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0972901  hitchhiker  0.0000118668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3051  hypothetical protein  28.81 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0572  hypothetical protein  25.71 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.767573  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8188  hypothetical protein  23.93 
 
 		 159 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2227  hypothetical protein  28.81 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.886761  hitchhiker  0.00000158862 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0956  hypothetical protein  27.78 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0108285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>