16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2055 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2055  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  250  4.0000000000000004e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0572  hypothetical protein  30.97 
 
 
116 aa  62.4  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.767573  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1439  hypothetical protein  32.14 
 
 
118 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00180208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3792  hypothetical protein  29.06 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0998  hypothetical protein  28.57 
 
 
128 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08970  hypothetical protein  27.83 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.197478 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1420  hypothetical protein  28.57 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000234918  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2682  hypothetical protein  30 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0836033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1820  hypothetical protein  29.25 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5208  hypothetical protein  34.65 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.954261  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0214  hypothetical protein  31.73 
 
 
117 aa  50.8  0.000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3051  hypothetical protein  26.67 
 
 
122 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3098  hypothetical protein  28.7 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000402787  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2569  hypothetical protein  27.62 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2354  hypothetical protein  32.76 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00810351  hitchhiker  0.0000298735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8188  hypothetical protein  25.53 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>