21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3251 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3251  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  250  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.072777  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3052  hypothetical protein  93.7 
 
 
127 aa  210  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3150  hypothetical protein  92.19 
 
 
131 aa  191  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1820  hypothetical protein  69.92 
 
 
142 aa  168  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3792  hypothetical protein  38.26 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2227  hypothetical protein  34.86 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.886761  hitchhiker  0.00000158862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2569  hypothetical protein  32.43 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2682  hypothetical protein  31.36 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0836033  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08970  hypothetical protein  27.87 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.197478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5208  hypothetical protein  34.52 
 
 
135 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.954261  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8188  hypothetical protein  29.59 
 
 
159 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2354  hypothetical protein  36.07 
 
 
130 aa  53.9  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00810351  hitchhiker  0.0000298735 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0956  hypothetical protein  24.76 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0108285  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0947  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.307454  normal  0.730618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3098  hypothetical protein  35.71 
 
 
116 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000402787  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0998  hypothetical protein  25.62 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2055  hypothetical protein  27.35 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0572  hypothetical protein  24.07 
 
 
116 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.767573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2414  hypothetical protein  34.41 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.437891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3051  hypothetical protein  23.77 
 
 
122 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1439  hypothetical protein  23.15 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00180208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>