30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0446 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0446  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000135804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2063  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  60.74 
 
 		 299 aa  364  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000263104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2002  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  40.33 
 
 		 276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000249092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1065  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  39.86 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00162251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0851  sporulation factor SpoIIGA  35.86 
 
 		 306 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000121402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1427  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  35.22 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0623098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1554  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  38.74 
 
 		 300 aa  169  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000760795  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0685  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  34.44 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00522326  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09140  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  30.19 
 
 		 298 aa  142  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017683  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0834  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  29.1 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0784  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  30.33 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000488598  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3732  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  28.01 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000105544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3950  sporulation sigma-E factor processing peptidase  28.29 
 
 		 308 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000829364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3958  sporulation sigma-E factor processing peptidase  28.43 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000155556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3756  sporulation sigma-E factor processing peptidase  27.96 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1235  sporulation sigma-E factor processing peptidase  28.1 
 
 		 305 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4044  sporulation sigma-E factor processing peptidase  27.96 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000128036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3647  sporulation sigma-E factor processing peptidase (stage II sporulation protein GA)  27.96 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000958412  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3920  sporulation sigma-E factor processing peptidase  27.74 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000219201 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3664  sporulation sigma-E factor processing peptidase (stage II sporulation protein GA)  27.96 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000467188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1029  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  27.45 
 
 		 308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000260513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2554  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  26.8 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1899  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  28.85 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4006  sporulation sigma-E factor processing peptidase  26.39 
 
 		 269 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00108073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1289  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  26.71 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2470  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  26.21 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295143  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1734  sporulation factor SpoIIGA  24.24 
 
 		 268 aa  85.5  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154682  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1309  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  30.9 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000941683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2016  sporulation factor SpoIIGA  23.91 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.483193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4055  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  25.83 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000601158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>