30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1029 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1029  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  100 
 
 
308 aa  627  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000260513  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1899  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  62.66 
 
 
304 aa  391  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3732  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  45.6 
 
 
305 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000105544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1235  sporulation sigma-E factor processing peptidase  45.28 
 
 
305 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503197  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3958  sporulation sigma-E factor processing peptidase  44.63 
 
 
305 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000155556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3756  sporulation sigma-E factor processing peptidase  44.3 
 
 
308 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883834  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3647  sporulation sigma-E factor processing peptidase (stage II sporulation protein GA)  44.3 
 
 
308 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000958412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3664  sporulation sigma-E factor processing peptidase (stage II sporulation protein GA)  44.3 
 
 
319 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000467188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4044  sporulation sigma-E factor processing peptidase  44.3 
 
 
308 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000128036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3950  sporulation sigma-E factor processing peptidase  43.97 
 
 
308 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000829364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3920  sporulation sigma-E factor processing peptidase  44.3 
 
 
305 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000219201 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2554  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  43.89 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4006  sporulation sigma-E factor processing peptidase  43.54 
 
 
269 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00108073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0851  sporulation factor SpoIIGA  30.65 
 
 
306 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000121402  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1065  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  28 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00162251  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1427  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  28.1 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0623098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1554  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  28.9 
 
 
300 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000760795  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2063  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  28.05 
 
 
299 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000263104  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2002  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  27.3 
 
 
276 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000249092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1289  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  27.57 
 
 
339 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0685  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  27.57 
 
 
301 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00522326  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0834  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  26.6 
 
 
293 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0446  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  27.45 
 
 
297 aa  106  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000135804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09140  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  25.08 
 
 
298 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4055  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  25.18 
 
 
296 aa  84  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000601158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2470  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  24.52 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295143  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2016  sporulation factor SpoIIGA  22 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.483193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1734  sporulation factor SpoIIGA  22 
 
 
268 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0784  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  27.55 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000488598  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1309  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  23.56 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000941683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>