29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2016 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2016  sporulation factor SpoIIGA  100 
 
 		 268 aa  530  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.483193  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1734  sporulation factor SpoIIGA  97.76 
 
 		 268 aa  521  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154682  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0834  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  26.44 
 
 		 293 aa  98.6  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.215008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0685  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  26.03 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00522326  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2063  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  24.83 
 
 		 299 aa  89  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000263104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1289  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  25.51 
 
 		 339 aa  88.2  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0784  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  26.83 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000488598  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2002  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  26.12 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000249092  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1029  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  22 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000260513  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0851  sporulation factor SpoIIGA  21.84 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000121402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3732  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  25.17 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000105544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1065  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  24.32 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00162251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1235  sporulation sigma-E factor processing peptidase  24.5 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3950  sporulation sigma-E factor processing peptidase  24.83 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000829364  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1554  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  24.24 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000760795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3958  sporulation sigma-E factor processing peptidase  24.16 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000155556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3920  sporulation sigma-E factor processing peptidase  25 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000219201 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3756  sporulation sigma-E factor processing peptidase  24.16 
 
 		 308 aa  72  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0883834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4044  sporulation sigma-E factor processing peptidase  24.16 
 
 		 308 aa  72  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000128036  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3647  sporulation sigma-E factor processing peptidase (stage II sporulation protein GA)  24.16 
 
 		 308 aa  72  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000958412  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3664  sporulation sigma-E factor processing peptidase (stage II sporulation protein GA)  24.16 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000467188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1899  sigma-E processing peptidase SpoIIGA  21.03 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0446  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  23.91 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000135804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2554  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  23.49 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09140  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  21.05 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2470  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  22.54 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1427  peptidase U4, sporulation factor SpoIIGA  21.16 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0623098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4006  sporulation sigma-E factor processing peptidase  21.46 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00108073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4055  peptidase U4 sporulation factor SpoIIGA  28.47 
 
 		 296 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000601158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>