25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4600 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4600  DNA-binding protein  100 
 
 		 112 aa  229  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.889226  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2307  DNA-binding protein  56.07 
 
 		 109 aa  130  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0826  DNA-binding protein  54.37 
 
 		 107 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4823  putative DNA-binding protein  58.42 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0343  putative DNA-binding protein  53.85 
 
 		 109 aa  120  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3080  putative DNA-binding protein  54.46 
 
 		 110 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100633  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3435  DNA-binding protein  54.46 
 
 		 110 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170412  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0675  putative DNA-binding protein  53.21 
 
 		 115 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  decreased coverage  0.00947691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0663  putative DNA-binding protein  53.21 
 
 		 115 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0642  putative DNA-binding protein  55.77 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.141676 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0799  putative DNA-binding protein  52.48 
 
 		 112 aa  107  8.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3144  hypothetical protein  51.38 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3371  hypothetical protein  47.71 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1057  putative DNA-binding protein  49.07 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3796  putative DNA-binding protein  49.49 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691719 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5076  putative DNA-binding protein  45.05 
 
 		 112 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798385 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05401  conserved hypothetical protein  46.23 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.656737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0891  hypothetical protein  34.58 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4567  hypothetical protein  30.39 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2157  hypothetical protein  31.19 
 
 		 116 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2310  hypothetical protein  30 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27190  hypothetical protein  29.7 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0719  hypothetical protein  30.69 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0906401  normal  0.324019 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0739  hypothetical protein  30.69 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.13396 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0725  hypothetical protein  30.69 
 
 		 113 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>