19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3796 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3796  putative DNA-binding protein  100 
 
 		 106 aa  216  8.999999999999998e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0642  putative DNA-binding protein  75.73 
 
 		 115 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.141676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0675  putative DNA-binding protein  74.76 
 
 		 115 aa  157  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  decreased coverage  0.00947691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0663  putative DNA-binding protein  74.76 
 
 		 115 aa  157  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1057  putative DNA-binding protein  70.19 
 
 		 119 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4823  putative DNA-binding protein  60.78 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5076  putative DNA-binding protein  60.19 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2307  DNA-binding protein  51.96 
 
 		 109 aa  102  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3080  putative DNA-binding protein  51.46 
 
 		 110 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100633  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3435  DNA-binding protein  50.49 
 
 		 110 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0343  putative DNA-binding protein  52.94 
 
 		 109 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0799  putative DNA-binding protein  46.6 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0826  DNA-binding protein  50.49 
 
 		 107 aa  93.6  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4600  DNA-binding protein  49.49 
 
 		 112 aa  89  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.889226  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05401  conserved hypothetical protein  44.86 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.656737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3371  hypothetical protein  46.15 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3144  hypothetical protein  46.15 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.185967  normal  0.858762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27190  hypothetical protein  32.35 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0891  hypothetical protein  32.35 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>