22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0719 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0719  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  225  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0906401  normal  0.324019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0725  hypothetical protein  99.12 
 
 
113 aa  223  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0739  hypothetical protein  99.12 
 
 
113 aa  223  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.13396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27190  hypothetical protein  68.27 
 
 
110 aa  146  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4567  hypothetical protein  43.27 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0891  hypothetical protein  42.31 
 
 
125 aa  76.6  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2310  hypothetical protein  41.18 
 
 
116 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521659 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2307  DNA-binding protein  41 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2157  hypothetical protein  38.46 
 
 
116 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4823  putative DNA-binding protein  38.1 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0826  DNA-binding protein  39.62 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3080  putative DNA-binding protein  37.61 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100633  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3435  DNA-binding protein  37.61 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5076  putative DNA-binding protein  37.93 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0642  putative DNA-binding protein  34.91 
 
 
115 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.141676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0663  putative DNA-binding protein  34.91 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0675  putative DNA-binding protein  34.91 
 
 
115 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  decreased coverage  0.00947691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0343  putative DNA-binding protein  37.25 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0799  putative DNA-binding protein  34.95 
 
 
112 aa  52  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4600  DNA-binding protein  30.69 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.889226  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1057  putative DNA-binding protein  33.98 
 
 
119 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05401  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
117 aa  43.5  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.656737  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>