21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2157 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2157  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  229  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2310  hypothetical protein  94.78 
 
 		 116 aa  221  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0891  hypothetical protein  45.13 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4567  hypothetical protein  44.34 
 
 		 121 aa  90.9  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27190  hypothetical protein  41.12 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.133249  normal  0.930343 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0725  hypothetical protein  38.46 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.609252  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0739  hypothetical protein  38.46 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.13396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0719  hypothetical protein  38.46 
 
 		 113 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0906401  normal  0.324019 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4600  DNA-binding protein  31.19 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.889226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4823  putative DNA-binding protein  35.29 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0343  putative DNA-binding protein  35.24 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0826  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3080  putative DNA-binding protein  33.02 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100633  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5076  putative DNA-binding protein  34.34 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798385 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3435  DNA-binding protein  33.02 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2307  DNA-binding protein  32.08 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0675  putative DNA-binding protein  31.48 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.205405  decreased coverage  0.00947691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0642  putative DNA-binding protein  31.48 
 
 		 115 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.141676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0663  putative DNA-binding protein  31.48 
 
 		 115 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1057  putative DNA-binding protein  32.73 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0799  putative DNA-binding protein  28 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>