87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3185 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3185  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  214  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3352  protein YqkA  44.16 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.584125  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0246  hypothetical protein  40.74 
 
 
176 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.643536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2591  hypothetical protein  43.94 
 
 
169 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.12292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2779  hypothetical protein  43.94 
 
 
169 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0119576  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0552  hypothetical protein  32.18 
 
 
347 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2329  hypothetical protein  38.96 
 
 
173 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.177131  normal  0.089639 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2542  hypothetical protein  43.94 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000082072  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06714  hypothetical protein  30 
 
 
173 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2788  hypothetical protein  42.42 
 
 
169 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2807  hypothetical protein  40.91 
 
 
172 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.062321  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0096  protein of unknown function UPF0157  38.46 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2508  hypothetical protein  42.42 
 
 
169 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2505  hypothetical protein  43.55 
 
 
169 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1089  hypothetical protein  34.38 
 
 
601 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3533  hypothetical protein  34.21 
 
 
175 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2828  hypothetical protein  39.39 
 
 
169 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.117917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3527  hypothetical protein  35.53 
 
 
175 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.283769  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1409  hypothetical protein  30.86 
 
 
318 aa  53.9  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2583  hypothetical protein  43.08 
 
 
169 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137167  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3326  protein of unknown function UPF0157  37.31 
 
 
211 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1247  protein of unknown function UPF0157  35.71 
 
 
197 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1584  hypothetical protein  30.86 
 
 
318 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3512  hypothetical protein  34.21 
 
 
175 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3572  hypothetical protein  32.89 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3312  hypothetical protein  32.89 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.488113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2673  hypothetical protein  29.17 
 
 
169 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00128043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2809  protein of unknown function UPF0157  34.25 
 
 
406 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3227  hypothetical protein  32.89 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3224  hypothetical protein  34.72 
 
 
178 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2428  hypothetical protein  29.17 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000686386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2751  protein of unknown function UPF0157  31.71 
 
 
221 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2465  hypothetical protein  29.58 
 
 
170 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.884514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2646  hypothetical protein  29.58 
 
 
170 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1655  protein of unknown function UPF0157  27.06 
 
 
191 aa  50.8  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2494  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  50.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.021339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2663  hypothetical protein  29.58 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000853592 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1699  glutamate-rich protein  27.27 
 
 
187 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.492225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0490  hypothetical protein  27.27 
 
 
176 aa  49.7  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000708419  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3050  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  30.77 
 
 
385 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0069  hypothetical protein  29.87 
 
 
319 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0605  protein of unknown function UPF0157  30.67 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3004  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  30.77 
 
 
385 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2831  hypothetical protein  38.33 
 
 
183 aa  49.3  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00971649  normal  0.206362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1708  hypothetical protein  28.17 
 
 
192 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_184  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.682808  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2000  hypothetical protein  35.8 
 
 
193 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3535  protein of unknown function UPF0157  29.58 
 
 
204 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  normal  0.357323 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0157  hypothetical protein  30.38 
 
 
176 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02640  hypothetical protein  35.38 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.451354  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3138  hypothetical protein  32.05 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2714  hypothetical protein  27.78 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3019  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  32.05 
 
 
385 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156562  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0920  hypothetical protein  32.35 
 
 
169 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2389  hypothetical protein  29.58 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00719854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1571  hypothetical protein  28.95 
 
 
365 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.332111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2637  glutamate-rich protein GrpB  24 
 
 
167 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000727014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3103  hypothetical protein  30.91 
 
 
171 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0343219  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12290  hypothetical protein  29.27 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2671  glutamate-rich protein GrpB  25.35 
 
 
169 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.267173  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2738  hypothetical protein  28.57 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0940497  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2729  protein of unknown function UPF0157  27.85 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208995  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2985  hypothetical protein  26.39 
 
 
181 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0439608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4110  protein of unknown function UPF0157  28.3 
 
 
170 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6527  protein of unknown function UPF0157  30.56 
 
 
251 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552897  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2708  hypothetical protein  25 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.95734  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2349  protein of unknown function UPF0157  30.65 
 
 
220 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63380  hypothetical protein  26.6 
 
 
242 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.903165  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1483  hypothetical protein  24.71 
 
 
197 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.496264  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1029  hypothetical protein  29.73 
 
 
174 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4207  protein of unknown function UPF0157  29.03 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.573704  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3053  protein of unknown function UPF0157  30.14 
 
 
194 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25790  hypothetical protein  32.26 
 
 
188 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2507  protein of unknown function UPF0157  25.97 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.309459  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1757  hypothetical protein  25.81 
 
 
178 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.334844  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2784  glutamate-rich protein GrpB  41.3 
 
 
150 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0346281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3559  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  25 
 
 
410 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.470533 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2990  protein of unknown function UPF0157  25 
 
 
171 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377938  normal  0.0790959 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2758  hypothetical protein  30.88 
 
 
170 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.459788  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4208  hypothetical protein  27.03 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4007  hypothetical protein  27.63 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.298552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4320  hypothetical protein  27.63 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4231  hypothetical protein  27.03 
 
 
174 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4131  hypothetical protein  21.67 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2072  protein of unknown function UPF0157  23.29 
 
 
194 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3353  dephospho-CoA kinase/protein folding accessory domain-containing protein  26.32 
 
 
402 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657332  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4167  hypothetical protein  25.68 
 
 
174 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>