More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1175 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1175  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
305 aa  618  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0716  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.98 
 
 
310 aa  371  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.012719  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0792  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.66 
 
 
310 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.130104  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1847  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.71 
 
 
308 aa  371  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.418665  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1313  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.98 
 
 
310 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.489329  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0567  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.36 
 
 
307 aa  353  2e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1083  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.72 
 
 
334 aa  338  5e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0818  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.22 
 
 
310 aa  326  3e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000104937  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1424  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.14 
 
 
304 aa  318  7e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0797  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.42 
 
 
307 aa  280  3e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.902258  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.81 
 
 
306 aa  215  9e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2017  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.02 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.23 
 
 
307 aa  209  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2119  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.48 
 
 
310 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1833  S-adenosyl-methyltransferase MraW  41.48 
 
 
310 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.22 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1034  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.76 
 
 
325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0963  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.91 
 
 
361 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0178075 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2479  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.56 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00084637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.48 
 
 
316 aa  199  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  38.69 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1985  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.52 
 
 
308 aa  195  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000115812  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.03 
 
 
349 aa  193  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1105  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.56 
 
 
327 aa  192  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2614  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.86 
 
 
320 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.624613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09010  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.96 
 
 
311 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0787  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.27 
 
 
309 aa  191  1e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0320  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.34 
 
 
349 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000221131  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0738  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.41 
 
 
332 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0462605  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1198  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.42 
 
 
315 aa  186  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00016413  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4071  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.78 
 
 
310 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0667  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.19 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.26 
 
 
313 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3751  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.54 
 
 
294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3196  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.54 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.421638  decreased coverage  0.00000374346 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1238  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.89 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.89 
 
 
311 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1296  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.53 
 
 
315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.83 
 
 
311 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24970  S-adenosyl-methyltransferase MraW  33.66 
 
 
327 aa  179  7e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.886239 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4816  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.97 
 
 
283 aa  178  8e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.05 
 
 
312 aa  178  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0744  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.24 
 
 
311 aa  178  1e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.33376  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3220  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.13 
 
 
371 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0668029 
 
 
-
 
NC_002620  TC0544  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.6 
 
 
302 aa  177  2e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.670425  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0864  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.24 
 
 
313 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.247156  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2663  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.54 
 
 
336 aa  176  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2210  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  36.27 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0172475  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3297  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.25 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.29 
 
 
302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0277587 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.88 
 
 
299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000417254  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1331  S-adenosyl-methyltransferase MraW  40.33 
 
 
293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3446  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.19 
 
 
372 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.597717  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.55 
 
 
299 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00424727  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.81 
 
 
311 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.21 
 
 
301 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2934  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.53 
 
 
337 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00284592  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0908  hypothetical protein  38.67 
 
 
310 aa  171  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0483  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.72 
 
 
312 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5774  S-adenosyl-methyltransferase MraW  33.88 
 
 
316 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.752734  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2980  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.71 
 
 
371 aa  168  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.540896  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3971  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.41 
 
 
310 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000219611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1884  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.74 
 
 
310 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0835  methyltransferase  36.57 
 
 
318 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3523  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.03 
 
 
305 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.550375  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3964  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.02 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3677  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.02 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2795  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.34 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000553872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.97 
 
 
313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4057  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.02 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3933  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.02 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0745363 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1562  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.76 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1222  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.1 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000949855  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1653  S-adenosyl-methyltransferase MraW  33.66 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.489649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3660  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.02 
 
 
310 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3745  S-adenosyl-methyltransferase MraW  38.02 
 
 
310 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.627703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.7 
 
 
310 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4019  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.78 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.219657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0975  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.77 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000346551  normal  0.234872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3207  S-adenosyl-methyltransferase MraW  33.99 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00627417  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.1 
 
 
339 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1727  S-adenosyl-methyltransferase MraW  37.17 
 
 
291 aa  163  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1012  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.07 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5106  S-adenosyl-methyltransferase MraW  32.37 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  0.108536 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33240  predicted protein  31.83 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.143284  normal  0.415774 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4200  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.33 
 
 
304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.87 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0855  S-adenosyl-methyltransferase MraW  39.53 
 
 
296 aa  161  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0122545  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2568  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.42 
 
 
310 aa  161  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0163  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.53 
 
 
299 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0366877 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4161  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36 
 
 
304 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3638  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.87 
 
 
313 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  33.77 
 
 
304 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3270  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.54 
 
 
330 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000287987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1102  methyltransferase  33.11 
 
 
330 aa  159  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.498999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4428  S-adenosyl-methyltransferase MraW  33.87 
 
 
301 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2748  S-adenosyl-methyltransferase MraW  34.54 
 
 
298 aa  159  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.1 
 
 
331 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  36.11 
 
 
314 aa  159  7e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>