8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3983 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3983  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.524901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2360  hypothetical protein  28.91 
 
 		 203 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.167171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6089  hypothetical protein  30.1 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.768175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0629  hypothetical protein  26.99 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2574  hypothetical protein  28.17 
 
 		 201 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.317138 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3389  hypothetical protein  32.08 
 
 		 190 aa  45.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133287  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2170  hypothetical protein  29.3 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.264761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3982  hypothetical protein  36.69 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163543  normal  0.279453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>