31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2140 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2140  putative lipoprotein  100 
 
 		 174 aa  354  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.318402  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0510  putative lipoprotein  38.75 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4435  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  38.61 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0525  redoxin domain-containing protein  37.25 
 
 		 187 aa  111  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  25.97 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  24.68 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  24.68 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  24.68 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1325  Redoxin domain protein  26.9 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.855613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  24.05 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  24.05 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  24.05 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  24.53 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  24.22 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  23.6 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1898  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.97 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000277693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  22.98 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0344  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.29 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00014833  hitchhiker  0.000312976 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0709  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  30 
 
 		 204 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.704361  normal  0.894516 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4074  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.59 
 
 		 355 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0949  redoxin domain-containing protein  28 
 
 		 222 aa  44.7  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2261  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.82 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.124304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3386  Redoxin domain protein  25.45 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.49355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.74 
 
 		 390 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.245531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.07 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3108  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.99 
 
 		 393 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.370556  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2509  putative thiol:disulfide interchange protein  24.82 
 
 		 165 aa  42  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.89 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3942  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.22 
 
 		 455 aa  40.8  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  22.94 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2013  thiol:disulfide interchange protein, thioredoxin family protein  26.67 
 
 		 176 aa  40.8  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>