27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2488 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2488  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  340  8e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133684  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0671  heptaprenyl diphosphate synthase component I  48.82 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00676924  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1084  hypothetical protein  42.11 
 
 		 184 aa  143  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0400129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14270  heptaprenyl diphosphate synthase component I  44.51 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.02688e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1320  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  40 
 
 		 177 aa  121  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000587453  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1464  hypothetical protein  40.59 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0347661  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1525  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  38.18 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1955  heptaprenyl diphosphate synthase component I  34.25 
 
 		 184 aa  98.2  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0511  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  41.51 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00260185  decreased coverage  0.0000000000443177 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3701  heptaprenyl diphosphate synthase component I  43.98 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00431641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0563  heptaprenyl diphosphate synthase component I  33.73 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.752463  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1463  heptaprenyl diphosphate synthase component I  31.43 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1501  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  33.11 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102642  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21280  predicted membrane protein  30.72 
 
 		 408 aa  72  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1098  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  36.42 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1115  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  33.73 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0348  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  28.48 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0037  hypothetical protein  29.76 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0773  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  24.84 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0124947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0235  heptaprenyl diphosphate synthase component I  25.31 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0068  heptaprenyl diphosphate synthase component I  27.22 
 
 		 176 aa  47.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1529  heptaprenyl diphosphate synthase component I  30.88 
 
 		 157 aa  47.4  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681929  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0213  heptaprenyl diphosphate synthase component I  28.4 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2908  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  30.84 
 
 		 170 aa  44.3  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.634002  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0691  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  28.1 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1926  hypothetical protein  28.68 
 
 		 362 aa  42.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.777208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>