58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21280 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21280  predicted membrane protein  100 
 
 		 408 aa  801    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1501  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  35.29 
 
 		 207 aa  107  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2361  hypothetical protein  33.54 
 
 		 171 aa  97.1  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3701  heptaprenyl diphosphate synthase component I  39.39 
 
 		 168 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00431641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1955  heptaprenyl diphosphate synthase component I  36.9 
 
 		 184 aa  94.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1084  hypothetical protein  33.97 
 
 		 184 aa  90.1  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0400129  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1525  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  30.49 
 
 		 176 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1320  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  34.34 
 
 		 177 aa  87.8  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000587453  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0511  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  37.87 
 
 		 177 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00260185  decreased coverage  0.0000000000443177 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0671  heptaprenyl diphosphate synthase component I  32.3 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00676924  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2488  hypothetical protein  30.72 
 
 		 176 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0773  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  33.95 
 
 		 183 aa  72  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0124947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14270  heptaprenyl diphosphate synthase component I  30.86 
 
 		 175 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.02688e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0348  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  36.21 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1464  hypothetical protein  31.76 
 
 		 176 aa  68.9  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0347661  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0691  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  36.52 
 
 		 187 aa  65.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0068  heptaprenyl diphosphate synthase component I  36.94 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0563  heptaprenyl diphosphate synthase component I  34.39 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.752463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1115  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  34.44 
 
 		 166 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1417  cobalt transport protein  24.41 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0162  cobalt transport protein  26.25 
 
 		 264 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000250375  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12580  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ  25.42 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1453  cobalt transport protein  25.37 
 
 		 267 aa  57  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000563289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0141  cobalt transport protein  24.38 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00214311  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0172  cobalt transport protein  24.38 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000818149  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0037  hypothetical protein  35.56 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0154  cobalt transport protein  24.38 
 
 		 264 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.51702e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0134  cobalt ABC transporter permease  24.38 
 
 		 264 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0906186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0136  cobalt ABC transporter permease  24.38 
 
 		 264 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000131502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0141  cobalt transport protein  24.38 
 
 		 264 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0141  cobalt transport protein  24.38 
 
 		 264 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00121096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5164  cobalt transport protein  25.62 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000252376  hitchhiker  0.0000000000119077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0136  cobalt transport protein  23.75 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000517715  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1463  heptaprenyl diphosphate synthase component I  23.21 
 
 		 173 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1926  hypothetical protein  22.81 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.777208  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0213  heptaprenyl diphosphate synthase component I  23.97 
 
 		 161 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0135  cobalt transport protein  22.5 
 
 		 264 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000281903  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0527  hypothetical protein  33.12 
 
 		 182 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0792  cobalt transport protein  21.63 
 
 		 267 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000295698  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0351  heptaprenyl diphosphate synthase component I  31.16 
 
 		 181 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1218  heptaprenyl diphosphate synthase component I  30.26 
 
 		 181 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0320  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  22.31 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00398229  hitchhiker  1.85295e-17 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2908  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  46 
 
 		 170 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.634002  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component I  30.26 
 
 		 181 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0138  cobalt transport protein  23.79 
 
 		 265 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1983  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ or related transporter  19.14 
 
 		 264 aa  47.8  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.498842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1730  cobalt transport protein  30.33 
 
 		 200 aa  47  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0142  cobalt transport protein  21.36 
 
 		 265 aa  47  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000226284  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0318  cobalt transport protein  22.78 
 
 		 262 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000082775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0290  ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ related transporter  22.29 
 
 		 266 aa  46.6  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00263469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2149  cobalt transport family protein  22.73 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.476733  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1151  cobalt transport protein  27.48 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00718127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2937  cobalt transport protein  23.12 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1947  cobalt ABC transporter permease protein  23.84 
 
 		 259 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.259406  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3805  cobalt transport protein  24.31 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.829315  normal  0.61527 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1686  cobalt transport protein  24.52 
 
 		 262 aa  44.3  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1702  cobalt transport protein  21.72 
 
 		 265 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1098  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  27.03 
 
 		 177 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>