31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2908 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2908  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  100 
 
 		 170 aa  313  6e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.634002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0068  heptaprenyl diphosphate synthase component I  50.6 
 
 		 176 aa  150  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0351  heptaprenyl diphosphate synthase component I  58.08 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0773  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  51.45 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0124947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0527  hypothetical protein  50.97 
 
 		 182 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0235  heptaprenyl diphosphate synthase component I  43.95 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0037  hypothetical protein  44.36 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2404  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  61.24 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.604994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1955  heptaprenyl diphosphate synthase component I  37.04 
 
 		 184 aa  91.7  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14270  heptaprenyl diphosphate synthase component I  35.66 
 
 		 175 aa  90.9  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.02688e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0511  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  39.33 
 
 		 177 aa  87.4  9e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00260185  decreased coverage  0.0000000000443177 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0671  heptaprenyl diphosphate synthase component I  33.54 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00676924  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2361  hypothetical protein  35.29 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1320  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  29.27 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000587453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1098  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  29.13 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00124747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2488  hypothetical protein  30.5 
 
 		 176 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1501  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  30 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000102642  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21280  predicted membrane protein  34.38 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1463  heptaprenyl diphosphate synthase component I  29.38 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0348  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  36.81 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0213  heptaprenyl diphosphate synthase component I  23.49 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1525  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  27.81 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1529  heptaprenyl diphosphate synthase component I  26.56 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681929  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1464  hypothetical protein  28.14 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0347661  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3701  heptaprenyl diphosphate synthase component I  31.14 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00431641  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1084  hypothetical protein  26.83 
 
 		 184 aa  51.2  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0400129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0563  heptaprenyl diphosphate synthase component I  30.95 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.752463  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1926  hypothetical protein  26.32 
 
 		 362 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.777208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1115  Heptaprenyl diphosphate synthase component I  27.01 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1218  heptaprenyl diphosphate synthase component I  27.15 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component I  27.15 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>