79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2055 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2055  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  659    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.690282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1769  hypothetical protein  98.47 
 
 		 326 aa  652    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1576  hypothetical protein  42.06 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0658  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  25 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.197282  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2401  Dihydroorotate dehydrogenase, electron transfer subunit, iron-sulfur cluster binding domain protein  24.22 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0875508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0645  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.15 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000010542  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5682  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.17 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.127651  normal  0.025786 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2095  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.62 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  26.32 
 
 		 761 aa  58.9  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5905  oxidoreductase FAD-binding subunit  22.78 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  hitchhiker  0.00602211 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2351  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.66 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1139  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  24.52 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1198  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  25.79 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.103373  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1383  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  26.4 
 
 		 246 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241691  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1152  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  24.31 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2666  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.46 
 
 		 271 aa  53.5  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0408  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  30.28 
 
 		 278 aa  52.8  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000248639  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1303  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  23.85 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0784  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.97 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2167  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  22.83 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0373  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  27.47 
 
 		 281 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00292172  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0374  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  22.12 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2935  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  25.11 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00112321  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0282  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  23.04 
 
 		 288 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1379  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.57 
 
 		 255 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3502  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  20.89 
 
 		 282 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.190562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09410  dihydroorotate oxidase B, electron transfer subunit  26.24 
 
 		 272 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000648454  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11870  2-polyprenylphenol hydroxylase-like oxidoreductase  19.67 
 
 		 264 aa  50.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00120516  normal  0.0310834 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0968  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  25.57 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000278582  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1301  oxidoreductase FAD-binding subunit  22.03 
 
 		 270 aa  49.7  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00150  ferric-chelate reductase, putative  31.15 
 
 		 589 aa  49.7  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0707362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1258  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  25.33 
 
 		 259 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3712  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  25.78 
 
 		 259 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2829  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  23.08 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0857645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2534  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  24.89 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3983  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  24.89 
 
 		 259 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2034  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  24.53 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000823862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0882  oxidoreductase FAD-binding subunit  22.48 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256079 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0082  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.42 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3934  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  24.44 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.551511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3644  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  24.44 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3899  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  24.44 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000118148 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3627  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  24.44 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0020  Dihydroorotate dehydrogenase, electron transfer subunit, iron-sulphur cluster binding domain protein  26.09 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4024  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  24.44 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.666798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3736  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  24.44 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3930  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  24.44 
 
 		 259 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1918  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  19.74 
 
 		 257 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0556  sulfite reductase, subunit B  30 
 
 		 266 aa  47  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1770  oxidoreductase FAD-binding subunit  23.79 
 
 		 276 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1280  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.07 
 
 		 262 aa  46.2  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0753  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  23.29 
 
 		 285 aa  46.2  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0022  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  22.94 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2546  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  25.68 
 
 		 281 aa  46.2  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1573  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.2 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0914  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  26.13 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.708996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1048  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  23.01 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1110  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.45 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0502  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  25.94 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000986289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0021  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  22.48 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.22 
 
 		 444 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  24.22 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1692  anaerobic sulfite reductase subunit B  23.26 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0858951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1685  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  27.06 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000469959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  24.22 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0831  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.44 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1467  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  24.88 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0370735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1111  dihydroorotate dehydrogenase electron transfer subunit  24.65 
 
 		 254 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0714398  normal  0.466144 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4015  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.77 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0098  dihydroorotate oxidase B, electron transfer subunit  24.81 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1426  anaerobic sulfite reductase subunit B  23.26 
 
 		 263 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0678  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  21.26 
 
 		 280 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0338  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  21.96 
 
 		 280 aa  43.5  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  24.09 
 
 		 747 aa  43.1  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0286  anaerobic sulfite reductase subunit B  23.9 
 
 		 263 aa  42.7  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1070  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  21.2 
 
 		 283 aa  42.7  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000853447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2795  ferredoxin-NADP(+) reductase subunit alpha  22.62 
 
 		 281 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  23.01 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1357  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.13 
 
 		 283 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00582058  normal  0.34047 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>