15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01170 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB01170  hypothetical protein  100 
 
 
1214 aa  2490    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.23154  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02740  high affinity cAMP phosphodiesterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05230)  32.67 
 
 
952 aa  200  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.400378 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78746  nucleotide phosphodiesterase  34.79 
 
 
565 aa  173  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0970062  normal  0.0386591 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34350  predicted protein  25.71 
 
 
401 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.719224  normal  0.952947 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30641  predicted protein  29.25 
 
 
614 aa  105  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0313408  normal  0.102836 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36270  predicted protein  23.74 
 
 
1987 aa  68.6  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47709  predicted protein  22.45 
 
 
1196 aa  67.8  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48350  predicted protein  19.68 
 
 
1773 aa  65.5  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0719027  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48354  predicted protein  23.26 
 
 
868 aa  65.1  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.951648  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49555  predicted protein  23.26 
 
 
1198 aa  64.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40689  predicted protein  22.86 
 
 
296 aa  61.6  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50428  predicted protein  21.38 
 
 
816 aa  58.2  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48375  predicted protein  24.89 
 
 
1169 aa  55.5  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50497  predicted protein  23.76 
 
 
1165 aa  54.3  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38549  predicted protein  22.84 
 
 
1128 aa  52.4  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>