20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2164 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2164  M48 family peptidase  100 
 
 		 403 aa  829    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.777176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1350  hypothetical protein  33.07 
 
 		 400 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1771  hypothetical protein  29.95 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219418  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1907  peptidase M48, Ste24p  26.54 
 
 		 291 aa  53.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.271345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6877  peptidase M48 Ste24p  25.81 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3380  peptidase M48 Ste24p  25.26 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.45173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2723  peptidase M48 Ste24p  25.26 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1434  peptidase M48, Ste24p  26.19 
 
 		 291 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.214994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4501  peptidase M48  25.15 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.274182  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0762  peptidase M48, Ste24p  25.33 
 
 		 319 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0736297  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0423  peptidase M48 Ste24p  28.05 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0412  peptidase M48 Ste24p  28.05 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1553  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 		 344 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.955824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5984  peptidase M48 Ste24p  25.23 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.968266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2454  peptidase M48 Ste24p  27.65 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.477087  normal  0.138125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2224  peptidase M48 Ste24p  26.06 
 
 		 303 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.772578  normal  0.0711266 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0247  heat shock protein HtpX  33.78 
 
 		 298 aa  43.5  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0423  peptidase M48 Ste24p  33.78 
 
 		 298 aa  43.5  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.666925  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1287  peptidase M48 Ste24p  26.35 
 
 		 291 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.899004 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3361  peptidase M48 Ste24p  25.24 
 
 		 351 aa  43.1  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>