17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1155 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1155  NapD  100 
 
 
111 aa  212  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.23731  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1934  periplasmic nitrate reductase component NapD  36.36 
 
 
115 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00219617  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0876  NapD  35.85 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0806  napD protein  34.91 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0306899  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1013  periplasmic nitrate reductase assembly protein  35.4 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.782122  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1226  napD protein  36.56 
 
 
112 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1722  NapD  32.88 
 
 
104 aa  53.9  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0730  periplasmic nitrate reductase component NapD  34.82 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000252519  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1521  periplasmic nitrate reductase NapD  30.7 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00135449  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4115  NapD  27.14 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.898096  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1769  NapD family protein  31.71 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0366  putative periplasmic nitrate reductase NapD  30.59 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.99839  hitchhiker  0.000161286 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0444  NapD family protein  31.58 
 
 
119 aa  42  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000021206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1935  NapD family protein  34.15 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.129658  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_3989  hypothetical protein  25.84 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0900917  normal  0.575525 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2384  NapD family protein  34.15 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.497858  normal  0.195982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1909  NapD family protein  34.15 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>