20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0444 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0444  NapD family protein  100 
 
 
119 aa  240  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000021206  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1521  periplasmic nitrate reductase NapD  46.02 
 
 
129 aa  111  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0730  periplasmic nitrate reductase component NapD  43.86 
 
 
117 aa  93.6  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000252519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1863  putative periplasmic nitrate reductase NapD  37.68 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1934  periplasmic nitrate reductase component NapD  30.09 
 
 
115 aa  50.8  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00219617  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0876  NapD  25.83 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3317  NapD family protein  28.89 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0806  napD protein  25 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0306899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0951  NapD  36.23 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1226  napD protein  27.03 
 
 
112 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0705  NapD family protein  28.89 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3147  NapD family protein  30.34 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0366  putative periplasmic nitrate reductase NapD  27.45 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.99839  hitchhiker  0.000161286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1020  NapD family protein  32.35 
 
 
95 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2843  NapD family protein  29.89 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2437  NapD family protein  29.89 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0849  napD protein  27.27 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1155  NapD  31.58 
 
 
111 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.23731  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3429  NapD family protein  27.27 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2980  NapD family protein  30.14 
 
 
86 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.060812 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>