19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1934 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1934  periplasmic nitrate reductase component NapD  100 
 
 
115 aa  226  6e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00219617  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1155  NapD  36.36 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.23731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0730  periplasmic nitrate reductase component NapD  31.9 
 
 
117 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000252519  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0876  NapD  33.94 
 
 
112 aa  62  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1722  NapD  35.96 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0806  napD protein  33.03 
 
 
112 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0306899  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1013  periplasmic nitrate reductase assembly protein  29.2 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.782122  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1226  napD protein  32.11 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0444  NapD family protein  30.09 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000021206  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2345  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.77 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02093  hypothetical protein  30.77 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3344  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.77 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0668522  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0734  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.77 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1443  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.77 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2506  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.77 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02134  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.77 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1452  NapD family protein  30.77 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2355  assembly protein for periplasmic nitrate reductase  30.77 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1521  periplasmic nitrate reductase NapD  27.97 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00135449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>