14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0448 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0448  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  100 
 
 		 111 aa  220  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6506  Conjugal transfer protein TrbC  78.12 
 
 		 113 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0161  Conjugal transfer protein TrbC  77.57 
 
 		 107 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4853  hypothetical protein  64.6 
 
 		 122 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4202  conjugal transfer protein TrbC  66.37 
 
 		 117 aa  133  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2657  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  72.57 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1754  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  86.59 
 
 		 113 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0872  conjugal transfer protein TrbC  43.84 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0068  type IV secretion system protein VirB2  43.08 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0110509  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0062  type IV secretion system protein VirB2  43.08 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6323  conjugal transfer protein TrbC  39.44 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0027  cmgB2  31.25 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2443  Conjugal transfer protein TrbC  45.45 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.624558 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0036  type IV secretory pathway VirB2 component  27.59 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>