13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4853 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4853  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  244  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4202  conjugal transfer protein TrbC  94.87 
 
 		 117 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6506  Conjugal transfer protein TrbC  78.16 
 
 		 113 aa  139  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2657  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  67.26 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1754  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  80 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0161  Conjugal transfer protein TrbC  73.27 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0448  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  64.6 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0068  type IV secretion system protein VirB2  43.48 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0110509  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0062  type IV secretion system protein VirB2  43.48 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0872  conjugal transfer protein TrbC  41.43 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6323  conjugal transfer protein TrbC  38.03 
 
 		 104 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0027  cmgB2  35.38 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2443  Conjugal transfer protein TrbC  40.74 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.624558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>