14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6506 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6506  Conjugal transfer protein TrbC  100 
 
 		 113 aa  223  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2657  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  89.25 
 
 		 113 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4853  hypothetical protein  78.16 
 
 		 122 aa  139  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4202  conjugal transfer protein TrbC  78.16 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1754  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  87.91 
 
 		 113 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0448  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  78.12 
 
 		 111 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0161  Conjugal transfer protein TrbC  78.02 
 
 		 107 aa  121  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0068  type IV secretion system protein VirB2  44.62 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0110509  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0062  type IV secretion system protein VirB2  44.62 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0872  conjugal transfer protein TrbC  39.73 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0027  cmgB2  33.75 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6323  conjugal transfer protein TrbC  39.44 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2443  Conjugal transfer protein TrbC  43.18 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.624558 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0036  type IV secretory pathway VirB2 component  31.08 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>