16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0161 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0161  Conjugal transfer protein TrbC  100 
 
 		 107 aa  214  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6506  Conjugal transfer protein TrbC  78.02 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0448  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  77.57 
 
 		 111 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4853  hypothetical protein  73.27 
 
 		 122 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4202  conjugal transfer protein TrbC  73.27 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2657  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  76.34 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1754  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  89.61 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0872  conjugal transfer protein TrbC  43.24 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0068  type IV secretion system protein VirB2  40.2 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0110509  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0062  type IV secretion system protein VirB2  40.2 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6323  conjugal transfer protein TrbC  36.46 
 
 		 104 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0027  cmgB2  33.85 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2443  Conjugal transfer protein TrbC  32.53 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.624558 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0036  type IV secretory pathway VirB2 component  28.26 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a008  attachment mediating protein TraC/VirB2  31.25 
 
 		 86 aa  41.6  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1488  Conjugal transfer protein TrbC  29.11 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>