14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2657 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2657  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  100 
 
 		 113 aa  225  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.326905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6506  Conjugal transfer protein TrbC  89.25 
 
 		 113 aa  166  8e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1754  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  78.76 
 
 		 113 aa  150  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9413 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4853  hypothetical protein  67.26 
 
 		 122 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4202  conjugal transfer protein TrbC  79.31 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0448  putative type IV secretion system protein VirB2/TraC  72.57 
 
 		 111 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0161  Conjugal transfer protein TrbC  76.34 
 
 		 107 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.862571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0872  conjugal transfer protein TrbC  41.1 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0068  type IV secretion system protein VirB2  44.62 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0110509  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0062  type IV secretion system protein VirB2  44.62 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0027  cmgB2  33.75 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6323  conjugal transfer protein TrbC  39.44 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0036  type IV secretory pathway VirB2 component  27.08 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2443  Conjugal transfer protein TrbC  43.18 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.624558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>