51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2721 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2721  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  440  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2539  hypothetical protein  44.07 
 
 
190 aa  161  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3830  hypothetical protein  43.35 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3745  hypothetical protein  41.28 
 
 
190 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6665  hypothetical protein  34.3 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742251  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0742  hypothetical protein  39.78 
 
 
194 aa  118  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0529  hypothetical protein  37.86 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0170564  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5821  hypothetical protein  34.57 
 
 
194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6186  hypothetical protein  34.57 
 
 
194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327018  normal  0.86985 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2436  hypothetical protein  38.2 
 
 
196 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.774495  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7732  hypothetical protein  34.97 
 
 
194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5536  hypothetical protein  34.12 
 
 
192 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0333  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000989305  hitchhiker  0.00834718 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0378  hypothetical protein  37.23 
 
 
180 aa  111  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1574  hypothetical protein  35.67 
 
 
186 aa  109  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452376 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1173  hypothetical protein  37.36 
 
 
187 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137716 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6760  hypothetical protein  35.56 
 
 
196 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5762  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.443693  normal  0.551739 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6007  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245957  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0374  hypothetical protein  39.71 
 
 
182 aa  107  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0274  hypothetical protein  36.73 
 
 
252 aa  102  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2674  hypothetical protein  36.73 
 
 
261 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0974  hypothetical protein  36.73 
 
 
252 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2402  hypothetical protein  37.16 
 
 
203 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0015  hypothetical protein  37.16 
 
 
203 aa  101  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4883  hypothetical protein  35.41 
 
 
224 aa  101  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6156  hypothetical protein  32.64 
 
 
194 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159993  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0442  hypothetical protein  39.24 
 
 
245 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0468  hypothetical protein  35.86 
 
 
253 aa  101  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0812  hypothetical protein  37.16 
 
 
203 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0816  hypothetical protein  37.16 
 
 
203 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.313298  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1755  hypothetical protein  37.96 
 
 
186 aa  100  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0946403  normal  0.917743 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1967  hypothetical protein  37.96 
 
 
186 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3293  hypothetical protein  34.76 
 
 
246 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.430478  normal  0.990698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0673  hypothetical protein  34.76 
 
 
246 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0553  hypothetical protein  41.3 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0645  hypothetical protein  36.81 
 
 
203 aa  96.7  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2081  hypothetical protein  35.43 
 
 
193 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2679  hypothetical protein  32.49 
 
 
202 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806298  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0457  hypothetical protein  40.58 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0473  hypothetical protein  40.58 
 
 
208 aa  94.7  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2571  hypothetical protein  34.17 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2697  hypothetical protein  34.17 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5977  hypothetical protein  32.49 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2650  hypothetical protein  31.98 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2039  hypothetical protein  31.98 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0652  hypothetical protein  34.38 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0518  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1183  hypothetical protein  31.13 
 
 
161 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1421  hypothetical protein  28.85 
 
 
193 aa  42.4  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000974382  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5657  hypothetical protein  40.74 
 
 
95 aa  42  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>