15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5657 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5657  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  196  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6760  hypothetical protein  61.7 
 
 
196 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6156  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159993  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6007  hypothetical protein  47.37 
 
 
194 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245957  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5762  hypothetical protein  47.37 
 
 
194 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.443693  normal  0.551739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7732  hypothetical protein  46.32 
 
 
194 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5821  hypothetical protein  46.32 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6186  hypothetical protein  46.32 
 
 
194 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327018  normal  0.86985 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6665  hypothetical protein  45.26 
 
 
194 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742251  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3745  hypothetical protein  50 
 
 
190 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5536  hypothetical protein  42.55 
 
 
192 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2721  hypothetical protein  40.74 
 
 
213 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0333  hypothetical protein  34.55 
 
 
199 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000989305  hitchhiker  0.00834718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2081  hypothetical protein  34.55 
 
 
193 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0742  hypothetical protein  37.74 
 
 
194 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>