50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0473 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0473  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0457  hypothetical protein  98.56 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0553  hypothetical protein  82.69 
 
 		 208 aa  359  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0468  hypothetical protein  78.87 
 
 		 253 aa  317  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0529  hypothetical protein  68.37 
 
 		 224 aa  287  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0170564  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3293  hypothetical protein  59.9 
 
 		 246 aa  244  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.430478  normal  0.990698 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2679  hypothetical protein  64.21 
 
 		 202 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5977  hypothetical protein  63.16 
 
 		 238 aa  241  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2571  hypothetical protein  63.68 
 
 		 202 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0974  hypothetical protein  62.63 
 
 		 252 aa  240  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0652  hypothetical protein  62.05 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0816  hypothetical protein  62.63 
 
 		 203 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.313298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0812  hypothetical protein  62.63 
 
 		 203 aa  240  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2650  hypothetical protein  63.68 
 
 		 202 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2039  hypothetical protein  63.68 
 
 		 202 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2697  hypothetical protein  63.16 
 
 		 202 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0274  hypothetical protein  62.63 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2674  hypothetical protein  62.63 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0673  hypothetical protein  58.33 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2402  hypothetical protein  62.63 
 
 		 203 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0015  hypothetical protein  62.63 
 
 		 203 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0442  hypothetical protein  53.74 
 
 		 245 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0645  hypothetical protein  62.83 
 
 		 203 aa  234  9e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1967  hypothetical protein  39.9 
 
 		 186 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1755  hypothetical protein  39.9 
 
 		 186 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0946403  normal  0.917743 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0378  hypothetical protein  40.43 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0374  hypothetical protein  38.02 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4883  hypothetical protein  40.1 
 
 		 224 aa  124  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2081  hypothetical protein  37.17 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3745  hypothetical protein  38.71 
 
 		 190 aa  121  9e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2436  hypothetical protein  39.13 
 
 		 196 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.774495  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0518  hypothetical protein  39.44 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2539  hypothetical protein  38.12 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1173  hypothetical protein  29.41 
 
 		 187 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137716 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0742  hypothetical protein  37.91 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0333  hypothetical protein  32.98 
 
 		 199 aa  98.2  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000989305  hitchhiker  0.00834718 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3830  hypothetical protein  40.68 
 
 		 194 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219865  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5536  hypothetical protein  32.43 
 
 		 192 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1574  hypothetical protein  31.61 
 
 		 186 aa  95.1  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452376 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2721  hypothetical protein  40.58 
 
 		 213 aa  94.7  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6760  hypothetical protein  36 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6186  hypothetical protein  32.28 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327018  normal  0.86985 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5821  hypothetical protein  32.28 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6665  hypothetical protein  31.87 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6007  hypothetical protein  30.73 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7732  hypothetical protein  30.53 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5762  hypothetical protein  30.73 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.443693  normal  0.551739 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6156  hypothetical protein  30.77 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159993  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1421  hypothetical protein  27.18 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000974382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1183  hypothetical protein  34.29 
 
 		 161 aa  41.6  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>