32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1421 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1421  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  404  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000974382  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2436  hypothetical protein  29.17 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.774495  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2400  hypothetical protein  29.23 
 
 
153 aa  58.2  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.763825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2081  hypothetical protein  35.96 
 
 
193 aa  58.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3745  hypothetical protein  40.28 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1173  hypothetical protein  30.93 
 
 
187 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137716 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0742  hypothetical protein  31.71 
 
 
194 aa  53.1  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0518  hypothetical protein  36.05 
 
 
185 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6760  hypothetical protein  31.71 
 
 
196 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1574  hypothetical protein  31 
 
 
186 aa  51.6  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452376 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0333  hypothetical protein  28.4 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000989305  hitchhiker  0.00834718 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5536  hypothetical protein  30.49 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0378  hypothetical protein  28.05 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0374  hypothetical protein  26.21 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7732  hypothetical protein  30.56 
 
 
194 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1183  hypothetical protein  25.29 
 
 
161 aa  45.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6156  hypothetical protein  29.63 
 
 
194 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159993  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4883  hypothetical protein  28.18 
 
 
224 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1973  hypothetical protein  25.53 
 
 
271 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6007  hypothetical protein  26.32 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245957  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5762  hypothetical protein  26.32 
 
 
194 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.443693  normal  0.551739 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6665  hypothetical protein  31.94 
 
 
194 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742251  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0553  hypothetical protein  28.28 
 
 
208 aa  43.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0473  hypothetical protein  27.18 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1967  hypothetical protein  25.3 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0457  hypothetical protein  27.18 
 
 
208 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1755  hypothetical protein  25.3 
 
 
186 aa  42.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0946403  normal  0.917743 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6186  hypothetical protein  31.94 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327018  normal  0.86985 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5821  hypothetical protein  31.94 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0529  hypothetical protein  28.92 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0170564  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2721  hypothetical protein  28.85 
 
 
213 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0468  hypothetical protein  28.74 
 
 
253 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>