50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2539 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2539  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3830  hypothetical protein  52.49 
 
 		 194 aa  185  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219865  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2721  hypothetical protein  44.07 
 
 		 213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3745  hypothetical protein  42.05 
 
 		 190 aa  121  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5536  hypothetical protein  37.28 
 
 		 192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1967  hypothetical protein  38.2 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1755  hypothetical protein  38.2 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0946403  normal  0.917743 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0378  hypothetical protein  36.16 
 
 		 180 aa  111  6e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0974  hypothetical protein  41.24 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0816  hypothetical protein  41.24 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.313298  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0812  hypothetical protein  41.24 
 
 		 203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0529  hypothetical protein  38.89 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0170564  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0457  hypothetical protein  38.12 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0015  hypothetical protein  41.24 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2402  hypothetical protein  41.24 
 
 		 203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0473  hypothetical protein  38.12 
 
 		 208 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0274  hypothetical protein  41.24 
 
 		 252 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2674  hypothetical protein  41.24 
 
 		 261 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3293  hypothetical protein  38.74 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.430478  normal  0.990698 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0553  hypothetical protein  36.76 
 
 		 208 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0673  hypothetical protein  39.25 
 
 		 246 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0468  hypothetical protein  38.07 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2436  hypothetical protein  38.32 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.774495  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0645  hypothetical protein  39.57 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0742  hypothetical protein  35.29 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0374  hypothetical protein  33.9 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1574  hypothetical protein  32.74 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00452376 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2571  hypothetical protein  37.57 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2697  hypothetical protein  37.57 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5977  hypothetical protein  37.57 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0652  hypothetical protein  37.57 
 
 		 223 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2679  hypothetical protein  37.57 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0442  hypothetical protein  35.89 
 
 		 245 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6665  hypothetical protein  34.5 
 
 		 194 aa  98.6  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7732  hypothetical protein  33.9 
 
 		 194 aa  97.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6186  hypothetical protein  34.5 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327018  normal  0.86985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2039  hypothetical protein  37.02 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6156  hypothetical protein  33.92 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159993  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5821  hypothetical protein  34.5 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2081  hypothetical protein  36.78 
 
 		 193 aa  97.1  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2650  hypothetical protein  37.02 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4883  hypothetical protein  35.03 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1173  hypothetical protein  35.5 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137716 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0333  hypothetical protein  34.22 
 
 		 199 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000989305  hitchhiker  0.00834718 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0518  hypothetical protein  35.43 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5762  hypothetical protein  32.18 
 
 		 194 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.443693  normal  0.551739 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6007  hypothetical protein  32.18 
 
 		 194 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6760  hypothetical protein  29.41 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2400  hypothetical protein  27.64 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.763825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1183  hypothetical protein  32.98 
 
 		 161 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>