18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1077 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1077  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733158  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2907  hypothetical protein  85.04 
 
 
161 aa  188  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0833  hypothetical protein  55.45 
 
 
127 aa  93.6  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1722  putative lipoprotein  53.25 
 
 
150 aa  72  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1084  hypothetical protein  47.37 
 
 
154 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0646  hypothetical protein  46.59 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1002  hypothetical protein  44.71 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1126  hypothetical protein  46.59 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2807  putative lipoprotein  44.59 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1797  putative lipoprotein  44.59 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2787  hypothetical protein  44.59 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2474  putative lipoprotein  44.59 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0535  putative lipoprotein  44.59 
 
 
142 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426405  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1006  hypothetical protein  47.14 
 
 
133 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849129  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2902  hypothetical protein  44.59 
 
 
142 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4238  hypothetical protein  47.14 
 
 
154 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.427979  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2848  RNA polymerase sigma factor RpoE  44.59 
 
 
392 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2178  hypothetical protein  45.21 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.162635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>