18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2787 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2848  RNA polymerase sigma factor RpoE  99.36 
 
 
392 aa  292  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2787  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  286  9e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1797  putative lipoprotein  99.36 
 
 
157 aa  285  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2807  putative lipoprotein  99.36 
 
 
157 aa  285  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2474  putative lipoprotein  99.36 
 
 
157 aa  285  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2902  hypothetical protein  99.3 
 
 
142 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0535  putative lipoprotein  99.3 
 
 
142 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426405  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1722  putative lipoprotein  86.58 
 
 
150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4238  hypothetical protein  46.9 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.427979  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2178  hypothetical protein  47.59 
 
 
154 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.162635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1084  hypothetical protein  48.32 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1002  hypothetical protein  48.97 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1126  hypothetical protein  48.28 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0646  hypothetical protein  56.47 
 
 
138 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1006  hypothetical protein  59.15 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849129  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0833  hypothetical protein  42.31 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2907  hypothetical protein  39.61 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1077  hypothetical protein  40.8 
 
 
127 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733158  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>