18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1002 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1002  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  285  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4238  hypothetical protein  90.97 
 
 		 154 aa  216  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.427979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1084  hypothetical protein  94.12 
 
 		 154 aa  205  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2178  hypothetical protein  86.11 
 
 		 154 aa  201  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.162635 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1126  hypothetical protein  95.14 
 
 		 154 aa  194  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0646  hypothetical protein  94.53 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1006  hypothetical protein  97.56 
 
 		 133 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1722  putative lipoprotein  51.82 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2474  putative lipoprotein  48.61 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2807  putative lipoprotein  48.61 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1797  putative lipoprotein  48.61 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2787  hypothetical protein  48.61 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2848  RNA polymerase sigma factor RpoE  48.61 
 
 		 392 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2902  hypothetical protein  50.78 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0535  putative lipoprotein  50.78 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426405  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2907  hypothetical protein  38.85 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0833  hypothetical protein  35.29 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1077  hypothetical protein  38.21 
 
 		 127 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>