18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1006 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1006  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  244  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.849129  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4238  hypothetical protein  92.68 
 
 
154 aa  178  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.427979  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1002  hypothetical protein  97.56 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1084  hypothetical protein  95.7 
 
 
154 aa  167  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2178  hypothetical protein  85.29 
 
 
154 aa  166  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.162635 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0646  hypothetical protein  97.62 
 
 
138 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1126  hypothetical protein  97.62 
 
 
154 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1722  putative lipoprotein  53.28 
 
 
150 aa  90.1  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2902  hypothetical protein  57.33 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1797  putative lipoprotein  57.33 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.600033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2787  hypothetical protein  57.33 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2807  putative lipoprotein  57.33 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2474  putative lipoprotein  57.33 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0535  putative lipoprotein  57.33 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426405  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2848  RNA polymerase sigma factor RpoE  57.33 
 
 
392 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0833  hypothetical protein  35.29 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1077  hypothetical protein  38.21 
 
 
127 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.733158  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2907  hypothetical protein  36.56 
 
 
161 aa  43.5  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0591897  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>