36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1884 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1884  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0593972 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2662  hypothetical protein  92.49 
 
 		 219 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5077  ureidoglycolate hydrolase  34.29 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.663593  normal  0.0343541 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21100  ureidoglycolate hydrolase  38.03 
 
 		 166 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.279715  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4288  ureidoglycolate hydrolase  36.62 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.823504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3614  ureidoglycolate hydrolase  36.62 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.13515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3852  ureidoglycolate hydrolase  36.62 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137447  normal  0.795271 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1580  ureidoglycolate hydrolase  36.62 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.190987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3821  ureidoglycolate hydrolase  38.03 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44860  ureidoglycolate hydrolase  38.03 
 
 		 169 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3669  ureidoglycolate hydrolase  38.36 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.532211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0080  ureidoglycolate hydrolase  36.62 
 
 		 162 aa  46.2  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1806  ureidoglycolate hydrolase  37.14 
 
 		 170 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1875  ureidoglycolate hydrolase  35.94 
 
 		 170 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397683  normal  0.0633216 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1948  ureidoglycolate hydrolase  35.94 
 
 		 170 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2760  ureidoglycolate hydrolase  35.21 
 
 		 167 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.607298  normal  0.437798 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6117  ureidoglycolate hydrolase  35.94 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1984  ureidoglycolate hydrolase  35.94 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.272161 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5275  ureidoglycolate hydrolase  35.94 
 
 		 170 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0821095 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1960  ureidoglycolate hydrolase  35.94 
 
 		 170 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0542  ureidoglycolate hydrolase  25.58 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1703  ureidoglycolate hydrolase  35.71 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.914773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0694  ureidoglycolate hydrolase  37.5 
 
 		 169 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0548  ureidoglycolate hydrolase  26.36 
 
 		 160 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5333  ureidoglycolate hydrolase  34.38 
 
 		 161 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835232  normal  0.631786 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2070  ureidoglycolate hydrolase  35.94 
 
 		 170 aa  42.4  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0569  ureidoglycolate hydrolase  32.81 
 
 		 160 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0623  ureidoglycolate hydrolase  32.81 
 
 		 160 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0916386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0562  ureidoglycolate hydrolase  32.81 
 
 		 160 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0564  ureidoglycolate hydrolase  32.81 
 
 		 160 aa  42.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.787947 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00455  ureidoglycolate hydrolase  25.58 
 
 		 160 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00460  hypothetical protein  25.58 
 
 		 160 aa  42  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0606  ureidoglycolate hydrolase  25.58 
 
 		 160 aa  42  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0439  ureidoglycolate hydrolase  25.58 
 
 		 160 aa  42  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0401643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3117  ureidoglycolate hydrolase  25.58 
 
 		 160 aa  42  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0579  ureidoglycolate hydrolase  25.58 
 
 		 160 aa  42  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>