80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1423 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3025  putative L-asparaginase II  86.23 
 
 
362 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1423  L-asparaginase II  100 
 
 
363 aa  743    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4062  L-asparaginase II  69.41 
 
 
353 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.351412  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4212  L-asparaginase II  68.77 
 
 
349 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.708537 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4304  L-asparaginase II  69.41 
 
 
353 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.086878  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3460  L-asparaginase II  69.69 
 
 
353 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1986  L-asparaginase II  69.34 
 
 
354 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3962  L-asparaginase II  65.16 
 
 
354 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.596306 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3455  L-asparaginase II  65.16 
 
 
354 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.282624 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5753  L-asparaginase II  63.05 
 
 
367 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.736318  normal  0.170575 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09195  thermolabile L-asparaginase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11890)  52.19 
 
 
356 aa  372  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.689937 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0311  L-asparaginase II  34.15 
 
 
334 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0555  hypothetical protein  37.96 
 
 
340 aa  206  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.943367  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0556  hypothetical protein  37.96 
 
 
340 aa  205  8e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01750  asparaginase  35.63 
 
 
334 aa  205  8e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2866  L-asparaginase II  37.36 
 
 
332 aa  205  9e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.687788  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3020  asparaginase  37.05 
 
 
331 aa  199  9e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2069  L-asparaginase II  38.02 
 
 
331 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0784  L-asparaginase II  36.1 
 
 
335 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.109561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3723  L-asparaginase II  36.3 
 
 
332 aa  186  6e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00962926 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0166  hypothetical protein  35.1 
 
 
317 aa  176  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0899  L-asparaginase II  34.38 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.499511 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13811  L-asparaginase II  36.02 
 
 
325 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0851  L-asparaginase II  35.1 
 
 
335 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1075  L-asparaginase II  37.78 
 
 
331 aa  169  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1336  L-asparaginase II  32.83 
 
 
336 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.156479  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3016  L-asparaginase II  32.73 
 
 
335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.41444 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0840  hypothetical protein  35 
 
 
325 aa  158  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4641  asparaginase  33.44 
 
 
316 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599926  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1815  hypothetical protein  34.16 
 
 
322 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.735411  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1163  hypothetical protein  33.81 
 
 
335 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0471275  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1785  L-asparaginase II  33.76 
 
 
317 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0198  hypothetical protein  32.88 
 
 
329 aa  156  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1384  hypothetical protein  37.35 
 
 
329 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0052  L-asparaginase II  37.15 
 
 
329 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.527495  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4556  L-asparaginase II  32.8 
 
 
315 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2503  L-asparaginase II  35.35 
 
 
328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.954342  normal  0.607101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0570  L-asparaginase II  32.37 
 
 
336 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878025  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10491  L-asparaginase II  27.9 
 
 
321 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3120  L-asparaginase II  33.23 
 
 
317 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3000  L-asparaginase II  33.23 
 
 
317 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169093  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0043  L-asparaginase II  35.63 
 
 
329 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3083  L-asparaginase II  40.81 
 
 
327 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000153504 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08881  L-asparaginase II  30.23 
 
 
320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.415864  hitchhiker  0.0000135273 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1961  L-asparaginase II  36.3 
 
 
338 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.91013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0733  L-asparaginase II  32.84 
 
 
317 aa  145  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000465625  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2513  L-asparaginase II  32.8 
 
 
317 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.852164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0266  L-asparaginase II  33.33 
 
 
335 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0222  L-asparaginase II  29.9 
 
 
320 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0254392  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08961  L-asparaginase II  29.55 
 
 
304 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09461  L-asparaginase II  27.89 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0821192  hitchhiker  0.0000193359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4623  L-asparaginase II  35.62 
 
 
329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.614226  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10491  L-asparaginase II  27.59 
 
 
321 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1567  L-asparaginase II  35.51 
 
 
316 aa  133  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.546836  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0979  L-asparaginase II  26.96 
 
 
321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.225004  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03610  L-asparaginase II  32.47 
 
 
336 aa  129  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.476586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3410  L-asparaginase II  35.84 
 
 
324 aa  129  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0378  L-asparaginase II  34.81 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0173551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37770  L-asparaginase II  35.51 
 
 
313 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.345752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3408  L-asparaginase II  31.35 
 
 
338 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3189  L-asparaginase II  32.54 
 
 
338 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1154  L-asparaginase II  33.03 
 
 
340 aa  122  8e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0435  L-asparaginase II  33.11 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0338  L-asparaginase II  32.53 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6126  L-asparaginase II  33.33 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0315  L-asparaginase II  33 
 
 
341 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5040  L-asparaginase II  38.55 
 
 
324 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1300  L-asparaginase II  37.08 
 
 
342 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.462652  normal  0.291361 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4204  L-asparaginase II  33.78 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0482  L-asparaginase II  33.68 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00939216  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0659  L-asparaginase II  34.78 
 
 
328 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0110  L-asparaginase II  33.12 
 
 
324 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.0405603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3023  L-asparaginase II  34.93 
 
 
349 aa  110  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18570  L-asparaginase II  31.13 
 
 
357 aa  106  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3757  L-asparaginase II  32.76 
 
 
348 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3975  L-asparaginase II  33.44 
 
 
347 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8238  L-asparaginase II  32.65 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.721473  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6297  hypothetical protein  31.58 
 
 
326 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195036  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0922  L-asparaginase II  31.1 
 
 
313 aa  89.4  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6476  L-asparaginase II  29.04 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0461805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>